Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms