Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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