Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FXNQ16595 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms