Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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E2F4Q16254 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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E2F4Q16254 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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E2F4Q16254 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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E2F4Q16254 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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E2F4Q16254 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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E2F4Q16254 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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