Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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NCAPHQ15003 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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