Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms