Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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KCNB1Q14721 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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KCNB1Q14721 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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KCNB1Q14721 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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KCNB1Q14721 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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KCNB1Q14721 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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KCNB1Q14721 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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KCNB1Q14721 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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KCNB1Q14721 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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KCNB1Q14721 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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