Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms