Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms