Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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