Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PTPRJQ12913 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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