Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms