Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms