Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms