Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms