Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DSC2Q02487 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DSC2Q02487 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DSC2Q02487 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DSC2Q02487 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DSC2Q02487 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DSC2Q02487 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DSC2Q02487 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DSC2Q02487 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DSC2Q02487 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DSC2Q02487 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DSC2Q02487 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DSC2Q02487 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DSC2Q02487 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DSC2Q02487 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DSC2Q02487 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms