Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms