Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms