Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms