Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX1P78337 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms