Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms