Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms