Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF10P55107 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF10P55107 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF10P55107 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms