Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms