Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1P51787 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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