Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms