Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNTAP49354 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTAP49354 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTAP49354 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms