Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ME1P48163 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ME1P48163 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms