Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRCP23327 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRCP23327 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRCP23327 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms