Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF6P18850 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF6P18850 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF6P18850 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF6P18850 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms