Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN2P17655 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms