Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOT1P17174 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOT1P17174 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOT1P17174 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOT1P17174 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
GOT1P17174 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOT1P17174 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms