Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 NUSAP1-203ENST00000450592 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 AC006355.1-201ENST00000440982 1012 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 ZRSR1-201ENST00000391338 1673 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms