Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HOXB3P14651 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC096732.1-201ENST00000439565 477 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 LINC01892-202ENST00000583985 540 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 LINC01198-206ENST00000595532 1125 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AL359641.1-201ENST00000412509 1558 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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