Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
IFITM1P13164 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
IFITM1P13164 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
IFITM1P13164 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
IFITM1P13164 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
IFITM1P13164 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
IFITM1P13164 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
IFITM1P13164 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
IFITM1P13164 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
IFITM1P13164 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
IFITM1P13164 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
IFITM1P13164 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
IFITM1P13164 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms