Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms