Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms