Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGTAO43765 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGTAO43765 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGTAO43765 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGTAO43765 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGTAO43765 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGTAO43765 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGTAO43765 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGTAO43765 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGTAO43765 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGTAO43765 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGTAO43765 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGTAO43765 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGTAO43765 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SGTAO43765 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SGTAO43765 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SGTAO43765 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGTAO43765 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SGTAO43765 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SGTAO43765 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SGTAO43765 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SGTAO43765 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGTAO43765 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGTAO43765 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGTAO43765 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SGTAO43765 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SGTAO43765 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGTAO43765 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGTAO43765 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGTAO43765 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SGTAO43765 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGTAO43765 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGTAO43765 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGTAO43765 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGTAO43765 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGTAO43765 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGTAO43765 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGTAO43765 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGTAO43765 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGTAO43765 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGTAO43765 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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