Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 MEF2C-AS1-206ENST00000511100 828 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC104123.1-203ENST00000513158 575 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 IL22-202ENST00000538666 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 KCNIP4-204ENST00000382150 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 MRPL47-202ENST00000392659 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 ZNF506-204ENST00000545006 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMINO43313 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMINO43313 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMINO43313 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMINO43313 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMINO43313 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
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