Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLGNO14967 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLGNO14967 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms