Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
O00370 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
O00370 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
O00370 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
O00370 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
O00370 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
O00370 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
O00370 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
O00370 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
O00370 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
O00370 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
O00370 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
O00370 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
O00370 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
O00370 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
O00370 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
O00370 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
O00370 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms