Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms