Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms