Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms