Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP69A5D8W1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms