Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms