Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms