Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms