Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms