Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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KLHL13Q9P2N7 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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KLHL13Q9P2N7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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KLHL13Q9P2N7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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KLHL13Q9P2N7 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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KLHL13Q9P2N7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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KLHL13Q9P2N7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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KLHL13Q9P2N7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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KLHL13Q9P2N7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL13Q9P2N7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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